qshinoの日記

Powershell関係と徒然なこと

ミネアポリスのGege floyd 死亡事件

経緯 ミネアポリス警察官が黒人男性の首を足で押さえつけ死亡させた事件。 無防備の黒人男性を死亡させたとし、黒人差別としてミネアポリスでは暴動が起き、全米に広がった。 また、暴動を取材していたCNNの黒人記者とスタッフが逮捕されたが、白人記者には…

下水と新型コロナ感染状況

下水と新型コロナ感染状況 関連資料 https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.05.19.20105999v1.full.pdf https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.22.20075200v2 https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.29.20045880v1.full.pdf

スーパーシティー法案

参照 https://www.kantei.go.jp/jp/singi/tiiki/kokusentoc/kettei/r20204.html

新型コロナの地平線

地平線とは 地面と空が交わる境界線。この言葉が生まれた時は地球が丸いと考えられていなかったと思われる。何故なら平という文字は、地面が平面と言う前提のもとに使われていると想像されるからである。 つまり、錯誤の元に作られた言葉が事実を認識した後…

R をjupyter に登録する

手順 install.packages('IRkernel') IRkernel::installspec() # to register IRkernel https://github.com/IRkernel/IRkernel/blob/master/README.md

covid19 memo

新しい迅速検査方法 20-25分 http://www.qlifepro.com/news/20200518/covid-19-3.html 感度はpcr相当

covid19 ウイルスの軌跡

ウイルスの軌跡 中国→欧州→米国 イラン株がほぼ無視されているのは、情報共有や交流の薄さが要因かも。 参考 https://www.wsj.com/graphics/coronavirus-mutations-map-the-global-outbreak-jp/

神奈川、COVID 19 症例

症例報告 神奈川の病院のcovid19症例報告 pdf http://www.kansensho.or.jp/uploads/files/topics/2019ncov/covid19_casereport_200312_4.pdf

愛知岐阜

愛知岐阜 5/14 専門家会議資料から、Rは五輪延期と愛知独自の緊急事態宣言の2日後に低下。一方、4/7愛知を除く緊急事態宣言に上昇効果。5/14の解除効果はこれから。 3/24 第一波最大、五輪延期 4/7 第一波最小、緊急事態宣言 4/10 愛知独自の緊急事態宣言 4/…

従来の風邪の抗体と新型コロナ免疫

従来の風邪のT細胞た新型コロナ https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30610-3

新型コロナの持続期間

各種新型コロナ持続期間 新型コロナウイルス、呼吸器組織より便から長期間検出 55人の便、39人の血清から新型コロナウイルスが検出され、尿から検出されたのは1人だけだった。便から検出される新型コロナウイルスの持続期間の中央値は22日で、呼吸器組織の18…

批判とは

批判、広辞苑 ひ‐はん【批判】 ひ‐はん【批判】 (criticism イギリス・Kritik ドイツ) ①物事の真偽や善悪を批評し判定すること。ひばん。 ②人物・行為・判断・学説・作品などの価値・能力・正当性・妥当性などを評価すること。否定的内容のものをいう場合が…

スペイン抗体検査

スペイン抗体検査 6万人の抗体検査を実施し、陽性者5% スペイン who 5/13 site report.114 感染者 228,030人 死者 26,920人 参照 https://this.kiji.is/633421289230124129 https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/2020051…

pandas loc, iloc, at, iat, []

psndas のスライス 基本的な話。 loc/iloc は複数スライス可能。 at/iatは基本的に1要素のみ iat, iloc は数値による指定 at, loc は行列の名称で指定。 df.xx[ 行名, 列名 ] df.ixx[ 行番号, 列番号] xxはat or loc 例 まとめ loc or at df.loc[行指定, 列…

感染症関連用語

用語集 再生産数R0: 免疫保持者がいない時の一人が感染させる人数。 実効再生産数R or Rt: ある状況における再生産数 感染日 : 感染した日。 発症日 : 発症した日。感染後、ある期間後に発症する。 Serial Interval : 感染連鎖の発症日から、次の感染者の発…

Pandas map/apply

pandas map,apply, applymap pandas の列や行の演算方法 列 .map() or .apply() 全要素: applymap() 列または行単位に全列または全行 .apply() 基本使用例 import pandas as pd a = pd.Dataframe([1,2,3]) a.iloc[1] = [2,4,6] # シリーズにの各要素に適用 a…

ハンマーアンドダンス

これ、やっと見つけた リンク https://medium.com/@tomaspueyo/coronavirus-the-hammer-and-the-dance-be9337092b56

今日のメモ

めも tesseract for python jsonlite for r 取り敢えず。

COVID関連指標

COVID19関連の情報 R再生算数。 R0 及びRt 前項の根拠となる、時系列な感染者数、その分母の検査数 医療状況、スタッフ、PPE, 機材、病床の充足利用状況。救急搬送時間、

Imperial colledge report

link https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/covid-19/covid-19-reports/

covidsim

covidsim 暇になったら試してみるかも。 リンク https://github.com/mrc-ide/covid-sim/blob/master/docs/inputs-and-outputs.md

抗体検査

NYC NYC 抗体検査報告 https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.30.20085613v1.full.pdf+html モスクワ 12.5%、5/24 https://www.cnn.co.jp/amp/article/35154250.html 神戸医療従事者 0/509 https://news.yahoo.co.jp/articles/421146061b71061a89…

Social distancing effect model

隔離による収束モデル 九大小田垣孝さん https://digital.asahi.com/sp/articles/ASN557T4WN54ULBJ01C.html?pn=7 NUB Modeling the impact of social distancing, testing, contact tracing and household quarantine on second-wave scenarios of the COVID…

年代別致命率

年代別致命率 中国 https://www.statista.com/statistics/1099662/china-wuhan-coronavirus-covid-19-fatality-rate-by-age-group/ 韓国 TBD 東京 TBD 下記にないかな? https://jag-japan.com/covid19map-readme/ シンガポール TBD その他 TBD

救急車の状況

救急車のたらい回し 30分以上搬送先が見つからないケースが、昨年の91%増加。 参考 https://r.nikkei.com/article/DGXMZO58758300S0A500C2CE0000

BCGと covid19

bcg BCGとcovid19感染者数の因果関係が疑われているが、現状不明確。 まだまだだね。 参考 https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)31025-4/fulltext

抗体検査キット

抗体検査キットの感染研評価結果 Day 13で96.9%、31/32 参考 https://www.niid.go.jp/niid/ja/diseases/ka/corona-virus/2019-ncov/9520-covid19-16.html

検査件数、検査人数、陽性者数の報告日

検査の報告日 新型コロナの統計データ中、検査人数、検査件数、陽性者数の報告日 毎日の記事によると、自治体の報告基準は、 検査人数、検査日基準 検査件数、結果判明日基準(退院検査込) 陽性者数、結果判明日基準 ここでの検査日は検体採取日? これが事実…

BBS法、データからR推定

BBS法 参考 https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/ej/%3Faction%3Drepository_action_common_download%26item_id%3D75530%26item_no%3D1%26attribute_id%3D1%26file_no%3D1 https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&url=https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/ej/%3…

西浦さん記事

大人気西浦さんの記事 参考 https://www.ism.ac.jp/editsec/toukei/pdf/54-2-461.pdf https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&url=https://www.ism.ac.jp/editsec/toukei/pdf/54-2-461.pdf&ved=2ahUKEwisooqzwJfpAhVKG6YKHQmGAOcQFjABegQIAhAB&us…